Lungenkarzinom Panel — Pathologie

Das Lungenkarzinom Panel umfasst die immunhistochemische Bestimmung des PD-L1-, ALK- und HER2-Status, die Untersuchung auf ALK- und ROS1-Rearrangements mittels FISH, einen EGFR-Schnelltest mittels Real-Time PCR sowie eine umfassende DNA- und RNA-basierte Analyse mittels NGS. Die Untersuchung ermöglicht u.a. den Nachweis klinisch relevanter Sequenzvarianten, Kopiezahlveränderungen und Fusionstranskripte und unterstützt die Risikostratifizierung sowie die Auswahl zielgerichteter Therapieoptionen.

Beschreibung

Indikation/Fragestellung

Risikostratifizierung, Therapiewahl

Methode

Immunhistochemie (PD-L1, ALK und HER2)
FISH (ALK und ROS1)
Real-Time PCR (EGFR-Schnelltest)
NGS (Oncomine Comprehensive Assay v3)

Probenmaterial

FFPE, zytologisches Probenmaterial

Probenannahme

Montag bis Freitag

Auftragserteilung

Schriftlich

Auftragsformular

Auftragsformular Molekulare Diagnostik

Bearbeitungsdauer

5 - 10 Arbeitstage

Bemerkungen/Besonderes

Keine

Verantwortlich

+41 71 494 21 28
+41 71 494 21 35

Weitere Informationen

EGFR-Schnelltest

Real-Time PCR basierte Analyse auf 85 EGFR Sequenzvarianten (G719X, T790M, S768I, Exon 20 Insertionen, L858R, L861Q und Exon 19 Deletionen) mittels EasyPGX® Ready EGFR (Diatech Pharmacogenetics). Methodisch bedingt können die folgenden Varianten nicht näher typisiert werden: p.(G719X), Exon 20 Insertionen, Exon 19 Deletionen.

Oncomine Comprehensive Assay v3 (161 Gene, ThermoFisher)

Sequenzvarianten in Hotspot-Regionen von 87 Genen:

AKT1, AKT2, AKT3, ALK, AR, ARAF, AXL, BRAF, BTK, CBL, CCND1, CDK4, CDK6, CHEK2, CSF1R, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2 (HER2), ERBB3, ERBB4, ERCC2, ESR1, EZH2, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FLT3, FOXL2, GATA2, GNA11, GNAQ, H3-3A, HIST1H3B, HNF1A, HRAS, IDH1, IDH2, JAK1, JAK2, JAK3, KIT, KNSTRN, KRAS, MAGOH, MAP2K1, MAP2K2, MAP2K4, MAPK1, MAX, MDM2, MED12, MET, MTOR, MYC, MYCN, MYD88, NFE2L2, NRAS, NTRK1, NTRK2, PDGFRA, PDGFRB, PIK3CA, PIK3CB, PPP2R1A, PTPN11, RAC1, RAF1, RET, RHEB, RHOA, ROS1, SF3B1, SMAD4, SMO, SPOP, SRC, STAT3, TERT, TOP1, U2AF1, XPO1

Sequenzvarianten in allen kodierenden Regionen von 48 Genen:

ARID1A, ATM, ATR, ATRX, BAP1, BRCA1, BRCA2, CDK12, CDKN1B, CDKN2A, CDKN2B, CHEK1, CREBBP, FANCA, FANCD2, FANCI, FBXW7, MLH1, MRE11A, MSH2, MSH6, NBN, NF1, NF2, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, PALB2, PIK3R1, PMS2, POLE, PTCH1, PTEN, RAD50, RAD51, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RB1, RNF43, SETD2, SLX4, SMARCA4, SMARCB1, STK11, TP53, TSC1, TSC2

Kopiezahlveränderungen (Amplifikation) in 43 Genen:

AKT1, AKT2, AKT3, ALK, AR, AXL, BRAF, CCND1, CCND2, CCND3, CCNE1, CDK2, CDK4, CDK6, CDKN2A, CDKN2B, EGFR, ERBB2 (HER2), ESR1, FGF19, FGF3, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FLT3, IGF1R, KIT, KRAS, MDM2, MDM4, MET, MYC, MYCL, MYCN, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PDGFRB, PIK3CA, PIK3CB, PPARG, RICTOR, TERT, TSC1, TSC2

Fusionstranskripte in 51 Driver Genen (RNA Panel):

AKT2, ALK, AR, AXL, BRAF, BRCA1, BRCA2, CDKN2A, EGFR, ERBB2 (HER2), ERBB4, ERG, ESR1, ETV1, ETV4, ETV5, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGR, FLT3, JAK2, KRAS, MDM4, MET, MYB, MYBL1, NF1, NOTCH1, NOTCH2, NRG1, NTRK1, NTRK2, NTRK3, NUTM1, PDGFRA, PDGFRB, PIK3CA, PRKACA, PRKACB, PPARG, PTEN, RAD51B, RAF1, RB1, RELA, RET, ROS1, RSPO2, RSPO3, TERT

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