Prostatakarzinom Panel — Pathologie
Das Prostatakarzinom Panel umfasst die Untersuchung auf Mismatch-Reparatur-Defizienz (MMRd) bzw. Mikrosatelliteninstabilität (MSI), des PTEN-Status sowie eine umfassende DNA- und RNA-basierte Analyse einschliesslich der Bestimmung des homologen Rekombinationsdefizienz-Status (HRD-Status) mittels NGS. Die Untersuchung unterstützt die Risikostratifizierung und die Auswahl zielgerichteter Therapieoptionen.
Indikation/Fragestellung | Risikostratifizierung, Therapiewahl |
|---|---|
Methode | Immunhistochemie (MMR und PTEN) |
Probenmaterial | FFPE, zytologisches Probenmaterial |
Probenannahme | Montag bis Freitag |
Auftragserteilung | Schriftlich |
Auftragsformular | |
Bearbeitungsdauer | 10 - 15 Arbeitstage |
Bemerkungen/Besonderes | Keine |
Verantwortlich |
Weitere Informationen
Mikrosatelliteninstabilität
OncoMate™ MSI Dx Analysis System (Promega). Mononukleotid-Mikrosatelliten BAT-25, BAT-26, NR-21, NR-24, MONO-27.
Oncomine Comprehensive Assay Plus (517 Gene, ThermoFisher)
Sequenzvarianten in Hotspot-Regionen von 10 Genen:
AKT1, AR, BRAF, CTNNB1, FOXA1, IDH1, IDH2, PIK3CA, SPOP, TERT
Sequenzvarianten in allen kodierenden Regionen von 14 Genen:
ARID1A, CDKN2A, CDKN2B, EPCAM, MLH1, MLH3, MSH2, MSH3, MSH6, PMS1, PMS2, PTEN, RB1, TP53
Sequenzvarianten in allen kodierenden Regionen von 36 Genen der homologen Rekombinationsreparatur (HRR):
ABRAXAS1, ATM, ATR, BARD1, BLM, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDK12, CHEK1, CHEK2, FANCA, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, MRE11, NBN, PALB2, PARP1, PARP2, RAD50, RAD51, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD52, RAD54L, RPA1, SLX4, XRCC2, XRCC3
Kopiezahlveränderungen (Amplifikation und Verlust) in 60 Genen:
ABRAXAS1, AKT1, AR, ATM, ATR, BAP1, BARD1, BLM, BRAF, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CCND1, CCND2, CCNE1, CDK12, CDKN2A, CDKN2B, CHEK1, CHEK2, ERBB2 (HER2), FANCA, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, KRAS, MECOM, MRE11, MTAP, MYC, NBN, NF1, NRAS, PALB2, PARP1, PARP2, PARP3, PIK3CA, POLD1, POLE, PPP2R2A, PTEN, RAD50, RAD51, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD52, RAD54L, RNASEH2A, RNASEH2B, RPA1, SLX4, TP53, XRCC2, XRCC3
Fusionstranskripte in 49 Driver Genen (RNA Panel):
AKT1, AKT2, AKT3, ALK, AR, BRAF, BRCA1, CDKN2A, EGFR, ERBB2 (HER2), ERBB4, ERG, ESR1, ETV1, ETV4, ETV5, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MAP3K8, MET, MTAP, MYB, MYBL1, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, NRG1, NTRK1, NTRK2, NTRK3, NUTM1, PIK3CA, PIK3CB, PPARG, PRKACA, PRKACB, RAF1, RARA, RELA, RET, ROS1, RSPO2, RSPO3, STAT6, TERT, TFE3, TFEB, YAP1
HRD-Status: Berechnung des Genomic Instability Metric (GIM)-Score auf Basis des probenspezifischen prozentualen Loss of Heterozygosity (%LOH).